Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LAMC2Q13753 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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