Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBA3CQ13748 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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