Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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