Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTGDRQ13258 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTGDRQ13258 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGDRQ13258 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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