Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DUSP4Q13115 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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