Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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