Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms