Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPRL3Q12980 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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