Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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AP1B1Q10567 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP1B1Q10567 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms