Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBRQ0VD83 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBRQ0VD83 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms