Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms