Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms