Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD51Q06609 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms