Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms