Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAV1Q03135 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAV1Q03135 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms