Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DSG1Q02413 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms