Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLCB3Q01970 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms