Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms