Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDKL1Q00532 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDKL1Q00532 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms