Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX6P78412 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX6P78412 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX6P78412 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX6P78412 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX6P78412 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX6P78412 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX6P78412 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms