Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P63121 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms