Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK11-1P61568 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms