Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V0D1P61421 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms