Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2MP61081 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2MP61081 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms