Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC01547P58512 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms