Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CABP4P57796 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CABP4P57796 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CABP4P57796 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CABP4P57796 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CABP4P57796 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CABP4P57796 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CABP4P57796 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CABP4P57796 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CABP4P57796 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms