Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms