Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA4P51532 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA4P51532 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms