Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB28P51157 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB28P51157 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB28P51157 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB28P51157 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB28P51157 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB28P51157 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB28P51157 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms