Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ETV1P50549 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ETV1P50549 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms