Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRE11P49959 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRE11P49959 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRE11P49959 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms