Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIK3CBP42338 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms