Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms