Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FLT4P35916 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FLT4P35916 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FLT4P35916 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FLT4P35916 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FLT4P35916 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms