Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTGER4P35408 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms