Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA7P31268 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA7P31268 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms