Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GTF2E2P29084 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2E2P29084 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms