Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB2P29033 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB2P29033 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms