Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD38P28907 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD38P28907 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD38P28907 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD38P28907 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD38P28907 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD38P28907 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD38P28907 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD38P28907 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD38P28907 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD38P28907 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD38P28907 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD38P28907 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD38P28907 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD38P28907 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD38P28907 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD38P28907 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD38P28907 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD38P28907 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD38P28907 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms