Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAP3P28838 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms