Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HTR1BP28222 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms