Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLNP26678 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLNP26678 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PLNP26678 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms