Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP5F1P24539 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms