Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRBP23467 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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