Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR4A1P22736 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms