Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XBP1P17861 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XBP1P17861 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XBP1P17861 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XBP1P17861 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XBP1P17861 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XBP1P17861 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XBP1P17861 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XBP1P17861 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XBP1P17861 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XBP1P17861 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms