Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LYL1P12980 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LYL1P12980 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms