Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT3P12035 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT3P12035 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT3P12035 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT3P12035 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRT3P12035 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRT3P12035 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT3P12035 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT3P12035 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT3P12035 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT3P12035 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT3P12035 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT3P12035 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT3P12035 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRT3P12035 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms