Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C8orf88P0DMB2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms