Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC4P09017 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC4P09017 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms